<html>
  <head>

    <meta http-equiv="content-type" content="text/html; charset=UTF-8">
  </head>
  <body text="#000000" bgcolor="#FFFFFF">
    <font size="-1">the reasoning about section3(d) and its application
      should be included in the suggested, near-time reforms of the
      patent system as proposed by Pirate Parties. spicyip has written
      quite a lot about the patent law section3(d) in india and its
      application is all but sensible (for instance, it is not extended
      to chemicals that are not pharmaceuticals, probably because the
      indian industry for chemicals is closer to being an originator
      industry than not - same controversy existsaround data exclusivity
      in the india/EU FTA, if one believes present india business
      statistics). <br>
      <br>
      well. the basis for the exception is sound, and it could very well
      be applicable within the EPC-zone (for instance). the last
      evaluation is biochemical patents in sweden was 2006, so there may
      be another one underway.<br>
      <br>
      /a<br>
    </font><br>
    -------- Original Message --------
    <table class="moz-email-headers-table" border="0" cellpadding="0"
      cellspacing="0">
      <tbody>
        <tr>
          <th valign="BASELINE" align="RIGHT" nowrap="nowrap">Subject: </th>
          <td>[SPICY IP] Application of Orphan Drug Act to section 3(d)?</td>
        </tr>
        <tr>
          <th valign="BASELINE" align="RIGHT" nowrap="nowrap">Date: </th>
          <td>Mon, 18 Jul 2011 00:08:12 -0700 (PDT)</td>
        </tr>
        <tr>
          <th valign="BASELINE" align="RIGHT" nowrap="nowrap">From: </th>
          <td>Rajiv Kr. Choudhry <a class="moz-txt-link-rfc2396E" href="mailto:rajiv.choudhry@gmail.com"><rajiv.choudhry@gmail.com></a></td>
        </tr>
        <tr>
          <th valign="BASELINE" align="RIGHT" nowrap="nowrap">Reply-To:
          </th>
          <td><a class="moz-txt-link-abbreviated" href="mailto:rajiv.choudhry@gmail.com">rajiv.choudhry@gmail.com</a></td>
        </tr>
        <tr>
          <th valign="BASELINE" align="RIGHT" nowrap="nowrap">To: </th>
          <td><a class="moz-txt-link-abbreviated" href="mailto:spicyip@googlegroups.com">spicyip@googlegroups.com</a></td>
        </tr>
      </tbody>
    </table>
    <br>
    <br>
    <a moz-do-not-send="true"
href="http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/0/0a/Spot_the_difference.png/500px-Spot_the_difference.png"
      imageanchor="1" style="clear: left; float: left; margin-bottom:
      1em; margin-right: 1em;"><img moz-do-not-send="true"
src="http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/0/0a/Spot_the_difference.png/500px-Spot_the_difference.png"
        width="320" border="0" height="176"></a><br>
    <div style="text-align: justify;">Long post follows:</div>
    <div style="text-align: justify;">In an earlier <a
        moz-do-not-send="true" href="http://goo.gl/h4PD3">post</a>, I
      had discussed providing for a numerical quantifier for section
      3(d) of our patents act and in <a moz-do-not-send="true"
        href="http://goo.gl/52S67">another</a> discussed of the
      possibility using an exclusionary definition of the term efficacy
      as relates to the act.<span style="mso-spacerun: yes;"> </span>This
      post provides a summary of definitions used in US Orphan Drug Act
      (ODA) to determine whether a drug is same or similar to another.<span
        style="mso-spacerun: yes;">  </span>This discussion is helpful
      to the Indian context because of two reasons: (1) the definitions
      as provided by the ODA consider similar issues as faced by our
      Controllers/Courts regarding defining efficacy for same or similar
      drugs, and (2) they have been applied and tested to specific cases
      and hence their impact and relative certainty can be measured.<span
        style="mso-spacerun: yes;">  </span></div>
    <br>
    <div class="MsoNormal" style="text-align: justify;">The ODA was
      enacted by US Congress to help a relatively small number of
      consumers who suffer from a rare disease as there was not enough
      incentive for research and development (“R&D”) for those small
      number of consumers suffering from rare diseases.<span
        style="mso-spacerun: yes;">   </span>The ODA provided an
      incentive to pharmaceutical company manufacturing drug to help
      those few individuals affected by any one (rare) disease or
      condition to overcome the financial losses.<span
        style="mso-spacerun: yes;">  </span>The incentive was a seven
      year market exclusivity for discovery of new orphan drugs.<span
        style="mso-spacerun: yes;">    </span>Specifically, a drug is
      an "orphan drug" if it is for a "rare disease or condition" that
      effects fewer than 200,000 patients in the United States or for
      which there is no reasonable expectation that the cost of
      developing the drug for a disease will be recovered from sales in
      the United States.<span style="mso-spacerun: yes;">  </span><a
        moz-do-not-send="true" href="http://goo.gl/Uz7lz">FDA definition</a>.</div>
    <div class="MsoNormal" style="text-align: justify;">A little bit of
      science and history:<span style="mso-spacerun: yes;">  </span>Prior
      to the development of recombinant proteins by the biotechnology
      industry, simple (and smaller) chemical structures provided a
      basis for most drugs and two drugs were considered the same if
      they had the same active moiety.<span style="mso-spacerun: yes;"> 
      </span><a moz-do-not-send="true" href="http://goo.gl/ezF64">See
        definitions</a>. <span style="mso-spacerun: yes;"> </span>“Active
      moiety means the molecule or ion, excluding those appended
      portions of the molecule that cause the drug to be an ester, salt
      (including a salt with hydrogen or coordination bonds), or other
      noncovalent derivative (such as a complex, chelate, or clathrate)
      of the molecule, responsible for the physiological or
      pharmacological action of the drug substance.”<span
        style="mso-spacerun: yes;">  </span>This approach of
      designating two structures worked well with small molecules
      because the chemical structure was a good indicator of a drug’s
      chemical syntheses.<span style="mso-spacerun: yes;">  </span>Therefore,
      changes to the chemical structure (of the active moiety) would
      most likely result in large pharmacologic differences for small
      molecules produced by chemical syntheses.</div>
    <div class="MsoNormal" style="text-align: justify;">This definition,
      however, does not work for large molecules such as recombinant
      proteins, polysaccharides or nucleic acids, or genes, or
      glycoproteins.<span style="mso-spacerun: yes;">  </span>Living
      organisms contain genes, a unit of heredity.<span
        style="mso-spacerun: yes;">  </span>Genes consist of
      deoxyribonucleic acid (DNA) and ribonucleic acid (RNA). <span
        style="mso-spacerun: yes;"> </span>DNA consists of two long
      polymers of "nucleotides." <span style="mso-spacerun: yes;"> </span>Nucleotides
      are arranged in a DNA molecule and a specific arrangement of the
      nucleotides is a "DNA sequence."<span style="mso-spacerun: yes;"> 
      </span>DNA encodes the information that living cells use to build
      proteins and other RNA molecules.<span style="mso-spacerun: yes;"> 
      </span>Proteins are essential parts of organisms and participate
      in virtually every process within cells.<span style="mso-spacerun:
        yes;">  </span>Functions include food digestion, metabolism,
      muscle formation, cell signaling, immune responses, etc.<span
        style="mso-spacerun: yes;">  </span>Proteins are made from
      amino acids using information encoded in genes. <span
        style="mso-spacerun: yes;"> </span>Each protein has its own
      unique amino acid sequence that is specified by the nucleotide
      sequence of the gene encoding this protein. <span
        style="mso-spacerun: yes;"> </span>The genetic code is a set of
      three-nucleotide sets called codons and each three-nucleotide
      combination designates an amino acid. <span style="mso-spacerun:
        yes;"> </span>Because DNA contains four nucleotides, the total
      number of possible codons is 64.<span style="mso-spacerun: yes;"> 
      </span>Genes encoded in DNA are first transcribed into
      pre-messenger RNA (mRNA) by proteins such as RNA polymerase. Most
      organisms then process the pre-mRNA (also known as a primary
      transcript) using various forms of posttranscriptional
      modification to form the mature mRNA, which is then used as a
      template for protein synthesis by the ribosome.<span
        style="mso-spacerun: yes;">  </span>(Definitions of gene,
      protein, nucleic acids, DNA taken and combined from Wikipedia). <span
        style="mso-spacerun: yes;"> </span></div>
    <div class="MsoNormal" style="text-align: justify;">Without a proper
      definition of "sameness," any market exclusivity for a gene, a
      protein, nucleotide, or a glycoprotein could be completely
      valueless, because competitors can easily substitute nucleotides
      to create a "different" gene coding for an identical protein.<span
        style="mso-spacerun: yes;">  </span>In proteins, there is a
      specific problem, because certain individual amino acids are
      generally structurally interchangeable (because of their similar
      basic structure and net charge) without producing a noticeable
      functional effect. </div>
    <div class="MsoNormal" style="text-align: justify;">To address the
      problems associated with these macromolecules, the ODA restricted
      the use of active moiety to small drug molecules and provided that
      large drug molecules cannot contain the "same principal molecular
      structure."<span style="mso-spacerun: yes;">  </span></div>
    <div class="MsoNormal" style="text-align: justify;">Specifically, <a
        moz-do-not-send="true" href="http://goo.gl/P98kM">the
        definitions</a> provide: </div>
    <div class="MsoNormal" style="text-align: justify;">(13) Same drug
      means:</div>
    <div class="MsoNormal" style="text-align: justify;">(i) If it is a
      drug composed of <span style="background: yellow; mso-highlight:
        yellow;">small molecules</span>, a drug that contains the <span
        style="background: yellow; mso-highlight: yellow;">same active
        moiety</span> as a previously approved drug and is intended for
      the same use as the previously approved drug, even if the
      particular ester or salt (including a salt with hydrogen or
      coordination bonds) or other noncovalent derivative such as a
      complex, chelate or clathrate has not been previously approved,
      except that if the subsequent drug can be shown to be clinically
      superior to the first drug, it will not be considered to be the
      same drug.</div>
    <div class="MsoNormal" style="text-align: justify;">(ii) If it is a
      drug composed of <span style="background: lime; mso-highlight:
        lime;">large molecules</span> (macromolecules), a drug that
      contains the <span style="background: lime; mso-highlight: lime;">same
        principal molecular structural features</span> (but not
      necessarily all of the same structural features) and is intended
      for the same use as a previously approved drug, except that, if
      the subsequent drug can be shown to be clinically superior, it
      will not be considered to be the same drug. This criterion will be
      applied as follows to different kinds of <span
        class="Apple-style-span" style="background-color: lime;">macromolecules</span>:</div>
    <div class="MsoNormal" style="text-align: justify;">(A) Two protein
      drugs would be considered the same if the only differences in
      structure between them were due to post-translational events or
      infidelity of translation or transcription or were minor
      differences in amino acid sequence; other potentially important
      differences, such as different glycosylation patterns or different
      tertiary structures, would not cause the drugs to be considered
      different unless the differences were shown to be clinically
      superior.</div>
    <div class="MsoNormal" style="text-align: justify;">(B) Two
      polysaccharide drugs would be considered the same if they had
      identical saccharide repeating units, even if the number of units
      were to vary and even if there were postpolymerization
      modifications, unless the subsequent drug could be shown to be
      clinically superior.</div>
    <div class="MsoNormal" style="text-align: justify;">(C) Two
      polynucleotide drugs consisting of two or more distinct
      nucleotides would be considered the same if they had an identical
      sequence of purine and pyrimidine bases (or their derivatives)
      bound to an identical sugar backbone (ribose, deoxyribose, or
      modifications of these sugars), unless the subsequent drug were
      shown to be clinically superior.</div>
    <div class="MsoNormal" style="text-align: justify;">(D) Closely
      related, complex partly definable drugs with similar therapeutic
      intent, such as two live viral vaccines for the same indication,
      would be considered the same unless the subsequent drug was shown
      to be clinically superior.</div>
    <div class="MsoNormal" style="text-align: justify;">FDA regulations
      <a moz-do-not-send="true" href="http://goo.gl/P98kM">define</a> a
      "clinically superior" drug as:</div>
    <div class="MsoNormal" style="text-align: justify;">(3)<span
        class="Apple-style-span" style="background-color: lime;">
        Clinically superior means that a drug is shown to provide a
        significant therapeutic advantage</span> over and above that
      provided by an approved orphan drug (that is otherwise the same
      drug) in one or more of the following ways:</div>
    <div class="MsoNormal" style="text-align: justify;">(i) Greater
      effectiveness than an approved orphan drug (as assessed by effect
      on a clinically meaningful endpoint in adequate and well
      controlled clinical trials). Generally, this would represent the
      same kind of evidence needed to support a comparative
      effectiveness claim for two different drugs; in most cases, direct
      comparative clinical trials would be necessary; or</div>
    <div class="MsoNormal" style="text-align: justify;">(ii) Greater
      safety in a substantial portion of the target populations, for
      example, by the elimination of an ingredient or contaminant that
      is associated with relatively frequent adverse effects. In some
      cases, direct comparative clinical trials will be necessary; or</div>
    <div class="MsoNormal" style="text-align: justify;">(iii) In unusual
      cases, where neither greater safety nor greater effectiveness has
      been shown, a demonstration that the drug otherwise makes a major
      contribution to patient care.</div>
    <div class="MsoNormal" style="text-align: justify;"><br>
    </div>
    <div class="MsoNormal" style="text-align: justify;">It can be seen
      that the <span class="Apple-style-span" style="background-color:
        lime;"><b>clinical superiority test is based on patient care
          rather than basing the test on structural similarity</b></span>.</div>
    <div class="MsoNormal" style="text-align: justify;">Hence under our
      patent act, section 3(d) may also be interpreted based on similar
      guidelines and if appropriate, similar guidelines may be used by
      our courts to interpret patent claims for new compounds.</div>
    <div class="MsoNormal" style="text-align: justify;">Our readers may
      wonder why I keep providing multiple definitions for section 3(d):<span
        style="mso-spacerun: yes;">  </span>The reason is
      simple-currently there are no guidelines that Assistant
      Controllers follow while rejecting or allowing patent claims under
      section 3(d).<span style="mso-spacerun: yes;">  </span>Each
      Asstt. Controller applies section 3(d) differently and just about
      anything is fair game when rejecting applications.<span
        style="mso-spacerun: yes;">  </span>The result is a mess.<span
        style="mso-spacerun: yes;">  </span>With no clear guideline,
      both the patentee and public suffer.<span style="mso-spacerun:
        yes;">  </span>Rejection of claims under section 3(d)
      differently leads to insufficient incentive to applicants.</div>
    <div class="MsoNormal" style="text-align: justify;"><br>
    </div>
    <div class="MsoNormal" style="text-align: justify;">Image from: <a
        moz-do-not-send="true"
        href="http://en.wikipedia.org/wiki/Spot_the_difference">http://en.wikipedia.org/wiki/Spot_the_difference</a> </div>
    <br>
    <br>
    --<br>
    Posted By Rajiv Kr. Choudhry to <a moz-do-not-send="true"
href="http://spicyipindia.blogspot.com/2011/07/application-of-orphan-drug-act-to.html">SPICY
      IP</a> at 7/18/2011 12:38:00 PM
    -- <br>
    You received this message because you are subscribed to the Google
    Groups "SPICY IP" group.<br>
    To post to this group, send email to <a class="moz-txt-link-abbreviated" href="mailto:spicyip@googlegroups.com">spicyip@googlegroups.com</a>.<br>
    To unsubscribe from this group, send email to
    <a class="moz-txt-link-abbreviated" href="mailto:spicyip+unsubscribe@googlegroups.com">spicyip+unsubscribe@googlegroups.com</a>.<br>
    For more options, visit this group at
    <a class="moz-txt-link-freetext" href="http://groups.google.com/group/spicyip?hl=en">http://groups.google.com/group/spicyip?hl=en</a>.<br>
    <br>
  </body>
</html>