<html>
  <head>

    <meta http-equiv="content-type" content="text/html; charset=UTF-8">
  </head>
  <body bgcolor="#FFFFFF" text="#000000">
    exceptions to patentable subject matter are interpreted narrowly.
    not seldom at the expense of all that is reasonable.<br>
    <br>
    -------- Original Message --------
    <table class="moz-email-headers-table" border="0" cellpadding="0"
      cellspacing="0">
      <tbody>
        <tr>
          <th align="RIGHT" nowrap="nowrap" valign="BASELINE">Subject: </th>
          <td>[The IPKat] Excluded Subject Matter American Style - <i>Association
              of Molecu...</i></td>
        </tr>
        <tr>
          <th align="RIGHT" nowrap="nowrap" valign="BASELINE">Date: </th>
          <td>Wed, 3 Aug 2011 11:50:04 -0700 (PDT)</td>
        </tr>
        <tr>
          <th align="RIGHT" nowrap="nowrap" valign="BASELINE">From: </th>
          <td>Matt <a class="moz-txt-link-rfc2396E" href="mailto:matt.ipkat@gmail.com"><matt.ipkat@gmail.com></a></td>
        </tr>
        <tr>
          <th align="RIGHT" nowrap="nowrap" valign="BASELINE">Reply-To:
          </th>
          <td><a class="moz-txt-link-abbreviated" href="mailto:matt.ipkat@gmail.com">matt.ipkat@gmail.com</a></td>
        </tr>
        <tr>
          <th align="RIGHT" nowrap="nowrap" valign="BASELINE">To: </th>
          <td><a class="moz-txt-link-abbreviated" href="mailto:ipkat_readers@googlegroups.com">ipkat_readers@googlegroups.com</a></td>
        </tr>
      </tbody>
    </table>
    <br>
    <br>
    <img moz-do-not-send="true"
src="http://4.bp.blogspot.com/-ClwKHuoD-5I/TjmXNrey7_I/AAAAAAAAATo/P8HeZO8HgLQ/s320/pond.jpg"
      style="float:right; margin:0 0 10px 10px;cursor:pointer;
      cursor:hand;width: 320px; height: 240px;" alt=""
      id="BLOGGER_PHOTO_ID_5636702669896871922" border="0">Important
    patent things have been happening ‘across the pond’ from the muggy
    and badly-ventilated London sweathouse that this particular Kat’s
    office has become over the past few days. (Readers will appreciate
    that this is not a reference to an actual pond – there little room
    for such an installation in the immediate vicinity of his office,
    and the inhabitants of the surrounding rooms would probably be less
    than impressed to find an impromptu water feature quite literally
    springing up under their desks (although given the weather in London
    at the moment the Kat is prepared to be proved wrong on this point).
    In any case, the Kat struggles to think of what patent related
    matters could be enacted on the other side of an actual pond that
    would: (a) be sufficiently important to grace the pages of this
    blog; and (b) have come to the Kat’s attention in any case. But I
    digress…). No, the reference to the pond (and things happening
    across it) is in fact an allusion to developments in the U.S. on
    patent matters in recent days). The Kat refers, in particular, to
    the decision of the Court of Appeals for the Federal Circuit (CAFC)
    in <i>The Association of Molecular Pathology & Ors v The USPTO
      and Myriad Genetics Inc</i>, __ F.3d __ (available <a
      moz-do-not-send="true"
href="http://www.cafc.uscourts.gov/images/stories/opinions-orders/10-1406.pdf">here</a>)
    (CAFC, 2011).<br>
    <br>
    The decision is relatively page-heavy, weighing in at 105, but of
    only modest heft in terms of words (in the region of 27,000 – a 5.1
    if you’re interested). It concerns, in part, the heated question of
    whether patents should be allowable in principle on isolated forms
    of naturally occurring DNA molecules – the short answer from the
    majority being “yes”.<br>
    <br>
    <b>Background</b><br>
    In essence, the Association of Molecular Pathology and a selection
    of other parties (collectively ‘the plaintiffs’) brought a suit
    against Myriad challenging the patentability of certain composition
    and method claims relating to human genetics. The challenged patents
    concerned two isolated human genes, BRCA1 and BRCA2, and certain
    mutations in these genes associated with a predisposition to ovarian
    and breast cancer – women with BRCA mutations, for example,
    apparently face a cumulative risk of between 50 to 80% of developing
    breast cancer (compared to the U.S. national average of 12-13%). The
    patents’ claims related to the isolated gene sequences themselves
    and to diagnostic methods of screening, analysing and comparing a
    patient’s BRCA sequence to the ‘normal’ sequence.<br>
    <br>
    <span class="Apple-style-span" style="color: rgb(0, 0, 238);
      -webkit-text-decorations-in-effect: underline; "><img
        moz-do-not-send="true"
src="http://1.bp.blogspot.com/-BZ0MERBNRXM/TjmW_uC7CjI/AAAAAAAAATY/pGpdPBx8HZo/s200/dna.gif"
        alt="" id="BLOGGER_PHOTO_ID_5636702430067100210" style="float:
        left; margin-top: 0px; margin-right: 10px; margin-bottom: 10px;
        margin-left: 0px; cursor: pointer; width: 200px; height: 160px;
        " border="0"></span>Having overcome the hurdles relating to
    standing (in contrast to the position in the UK, where there is no
    requirement of standing – s72 PA 1977 simply states that the “court…
    may by order revoke a patent for an invention on the application of
    any person” (emphasis supplied) – under U.S. law in order to bring a
    declaratory judgment suit challenging the validity of a patent a
    party must demonstrate that there is a “a case of actual
    controversy” of the type justiciable under Article III of the U.S.
    Constitution. In patent cases, this has been interpreted to mean
    that there must be a “definite and concrete” dispute that touches
    “the legal relations of parties having adverse legal interests,”
    which is “real and substantial,” and which admits of “specific
    relief through a decree of a conclusive character, as distinguished
    from an opinion advising what the law would be upon a hypothetical
    state of facts.” (See <i>MedImmune v Genentech</i>, 549 U.S. 118,
    at 127 (Sup Ct, 2007)), the Court moved to consider the main issue
    at play in the case: patentable subject-matter.<br>
    <br>
    <b>Patentable Subject-Matter</b><br>
    Myriad had argued that the lower court’s rejection of its claims to
    “isolated” DNA sequences under §101 as “products of nature” was
    incorrect on a number of grounds. In particular, it alleged that the
    district court had: misread “Supreme Court precedent as excluding
    from patent eligibility all “products of nature” unless “markedly
    different” from naturally occurring ones”; and incorrectly focused
    on the similarity in the informational content between isolated and
    native DNAs rather than on their marked differences in other areas.
    Accordingly, it argued that “an isolated DNA molecule is patent
    eligible because it is, as claimed, “a nonnaturally occurring
    composition of matter” with “a distinctive name, character, and
    use.”<br>
    <br>
    Myriad argued that as isolated DNA does not exist in nature, it
    could not be considered to be a “product” thereof. Furthermore, any
    categorical interpretation of this exception to patent eligibility
    would not only be “unworkable, as every composition of matter is, at
    some level, composed of natural materials”, but would also be
    contrary to precedent.<br>
    <br>
    The plaintiffs, on the other hand, argued that claims to isolated
    DNA molecules failed to satisfy the §101 standard as “such claims
    cover natural phenomena and products of nature.” Accordingly, they
    asserted that Supreme Court precedent stated that a product of
    nature was not patent eligible even if it had undergone some highly
    useful change from its natural form. The critical question was
    whether the composition of matter had a distinctive name, character,
    and use, making it “markedly different” from the natural product.
    Only then would it be patent eligible. On the current facts, the
    plaintiffs argued that because the isolated DNAs retained the same
    nucleotide sequence as native DNAs, they did not have any “markedly
    different” characteristics.<br>
    <br>
    <img moz-do-not-send="true"
src="http://3.bp.blogspot.com/-8QTC3gO4BKQ/TjmW0OkDWkI/AAAAAAAAATQ/wwZHqDq6WeI/s320/Myriad.gif"
      alt="" id="BLOGGER_PHOTO_ID_5636702232637561410" style="float:
      right; margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 10px;
      margin-left: 10px; cursor: pointer; width: 275px; height: 213px; "
      border="0">Circuit Judge Lourie, giving the opinion for the court,
    explained that the distinction “between a product of nature and a
    human-made invention for purposes of §101 turns on a change in the
    claimed composition’s identity compared with what exists in nature.
    Specifically, the Supreme Court has drawn a line between
    compositions that, even if combined or altered in a manner not found
    in nature, have similar characteristics as in nature, and
    compositions that human intervention has given “markedly different,”
    or “distinctive,” characteristics.”<br>
    <br>
    Accordingly, the fact that Myriad was claiming isolated DNAs – “a
    free-standing portion of a native DNA molecule” – was determinative.
    As Judge Lourie explained, isolated DNA is not simply purified DNA:<br>
    <blockquote>“Purification makes pure what was the same material, but
      was previously impure. Although isolated DNA must be removed from
      its native cellular and chromosomal environment, it has also been
      manipulated chemically so as to produce a molecule that is
      markedly different from that which exists in the body. It has not
      been purified by being isolated.”</blockquote>
    Discussing the approach of the district court, Judge Lourie
    considered it had fallen into error in considering not whether the
    isolated DNAs were markedly different, in that they had a
    “distinctive characteristic” to distance them from naturally
    occurring DNAs, but rather whether they had the same informational
    content as native DNA sequences.<br>
    <blockquote>“Adopting this approach, the district court disparaged
      the patent eligibility of isolated DNA molecules because their
      genetic function is to transmit information. We disagree, as it is
      the distinctive nature of DNA molecules as isolated compositions
      of matter that determines their patent eligibility rather than
      their physiological use or benefit. Uses of chemical substances
      may be relevant to the non-obviousness of these substances or to
      method claims embodying those uses, but the patent eligibility of
      an isolated DNA is not negated because it has similar
      informational properties to a different, more complex natural
      material that embodies it.”</blockquote>
    Nevertheless, the CAFC considered that the district court was
    correct in holding that Myriad’s claims directed to comparing and
    analysing gene sequences were patent ineligible, as these claims
    contained no transformative steps and covered only patent ineligible
    abstract steps. Finally, the claims directed to methods of screening
    potential cancer therapeutics via changes in cell growth rates were
    considered to be patent eligible, presenting, as they did,
    ““functional and palpable applications” in the field of
    biotechnology”<br>
    <br>
    Circuit Judge Moore, concurring in part, noted that<br>
    <blockquote>“DNA is a chemical polymer. In principle, a polymeric
      DNA sequence is no different than any other well known polymer,
      for example, nylon. Like any polymer, DNA is made up of repeating
      monomer units, connected by chemical bonds to form one larger
      molecule.”</blockquote>
    Nevertheless:<br>
    <blockquote>“Isolation of a DNA sequence is more than separating out
      impurities: the isolated DNA is a distinct molecule with different
      physical characteristics than the naturally occurring polymer
      containing the corresponding sequence in nature.”</blockquote>
    <div>According to Circuit Judge Moore, the fact that human action
      had “whittled the chromosomal DNA molecule down” to a shortened
      version of its natural self, “defining the parts to be retained
      and discarded” rendered it “entirely different” from the naturally
      occurring gene from which it was obtained. </div>
    <br>
    Circuit Judge Moore explained that whilst she might conclude that
    and isolated DNA sequence that includes most or all of a gene was
    not patentable subject matter if she was approaching the factual
    matrix from a blank canvas, this was not in fact the case. There was
    a “substantial historical background” with the courts having been
    authorised by Congress to approach the issue of patentable subject
    matter expansively. The established practice was to allow patents on
    isolated DNA sequences – such patents having being allowed by the
    USPTO for “decades” according to the Judge.<br>
    <br>
    Accordingly, the Judge explained that she considered that “we must
    be particularly wary of expanding the judicial exception to
    patentable subject matter where both settled expectations and
    extensive property rights are involved. Combined with my belief that
    we should defer to Congress, these settled expectations tip the
    scale in favor of patentability.”<br>
    <br>
    Nevertheless, as <a moz-do-not-send="true"
href="http://www.patentlyo.com/patent/2011/07/federal-circuit-isolated-human-dna-molecules-are-patentable.html">numerous</a>
    <a moz-do-not-send="true"
href="http://www.pharmapatentsblog.com/federal-circuit-decisions/federal-circuit-decides-myriad-oks-isolated-dna-claims/">commentators</a>
    who have been quicker off the mark than this Kat in digesting this
    judgment have noted, whilst diluted somewhat Myriad’s patents remain
    strong and the plaintiffs are likely to seek an en banc rehearing in
    the CAFC or file a writ of certiorari with the Supreme Court.
    <br>
    <br>
    --<br>
    Posted By Matt to <a moz-do-not-send="true"
href="http://ipkitten.blogspot.com/2011/08/excluded-subject-matter-american-style.html">The
      IPKat</a> on 8/03/2011 04:01:00 PM
    -- <br>
    You received this message because you are subscribed to the IPKat's
    email readers' group.<br>
    For forthcoming events, check the IPKat's sidebar at <a href="<a
      moz-do-not-send="true" href="http://www.ipkat.com">http://www.ipkat.com</a>><a class="moz-txt-link-abbreviated" href="http://www.ipkat.com">www.ipkat.com</a></a><br>
    To unsubscribe, email the IPKat <a
href=<a class="moz-txt-link-rfc2396E" href="mailto:ipkat_readers+unsubscribe@googlegroups.com">"mailto:ipkat_readers+unsubscribe@googlegroups.com"</a>>here</a><br>
    <br>
  </body>
</html>